Concebido como un centro educativo de investigación científica y lugar de encuentro sociocultural, es un laboratorio viviente para el estudio de plantas tropicales y las muchas especies de aves que lo habitan. Es también un área de recreación y esparcimiento para sus visitantes.
Sus predios, abarcan unas 289 cuerdas de terreno. Cuenta con un Herbario que custodia más de 36,000 ejemplares de plantas disecadas. El Jardín provee al público conocimiento sobre temas relacionados con la flora nativa e información sobre temas ecológicos para la preparación de proyectos escolares.
Se ofrecen recorridos guiados, talleres, seminarios, conferencias y exhibiciones para estudiantes, la comunidad y el público en general. Un importante recurso, con acceso disponible por cita previa a investigadores, es la Biblioteca del Servicio Forestal Federal.
El Jardín se divide en dos partes por la carretera PR-1: el Jardín Botánico Norte y el Jardín Botánico Sur. La mayor parte de las atracciones para visitantes se encuentran en el Jardín Botánico Sur.
Jardín Botánico Norte
En la sección norte se encuentran el herbario, viveros de plantas ornamentales y el vivero de árboles del Fideicomiso de Conservación. También ubican los edificios de Editorial de la Universidad de Puerto Rico, las oficinas administrativas Estación Experimental Agrícola de San Juan y la biblioteca especializada en botánica y agronomía del Servicio Forestal. En esta sección también se encuentra un Centro de Desarrollo Preescolar y las oficinas del Instituto Filius de Investigaciones sobre Impedimentos y Rehabilitación.
Jardín Botánico Sur
En la sección sur ubica el centro de información, el área de estacionamiento, y la tienda de libros y regalos “Verde que te quiero Verde”. También alberga los edificios de la Administración Central de la Universidad de Puerto Rico, veredas, jardines temáticos, esculturas y plantas nativas de Puerto Rico, muchas en peligro de extinción.